Samoa'nın ilk gerçek ulusal bayrağının 2 Ekim 1873'te kabul edildiği görülüyor. Kırmızı fonda bayrağın kenarlarına uzanan beyaz bir haç ve üst kaldırma köşesinde beyaz bir yıldız vardı. Sembolizm bilinmemektedir, ancak haç ve yıldız sırasıyla Hıristiyanlığı ve bağımsızlığı temsil etmiş olabilir. Bölgeyi ziyaret eden Almanları destekleyen Kral Tamasese, daha sonra beyaz olanın üzerine siyah bir haç koyarak ulusal bayrağı değiştirdi ve Alman kırmızı-beyaz-siyah renklerini Samoa'ya verdi. Bu bayrak 1886'dan 1889'a kadar kullanılıyordu, ancak Tamasese'nin ölümünden sonra kullanılmaya son verildi. Amerika Birleşik Devletleri ve Almanya 1900'de adaları böldüler ve yerel bayrakların teşvik edilmediği ayrı korumalar kurdu.
20. yüzyılın başlarında eski Alman toprakları Yeni Zelanda tarafından yönetiliyordu. Bu adalar için, kırmızı-beyaz-mavi renkleri, Güney Haçı takımyıldızı ve tarla ve kanton tasarımında Yeni Zelanda bayrağını yansıtan yerel bir bayrak geliştirildi. 26 Mayıs 1948'de tanıtılan yeni Samoa bayrağı mavi bir kantonda dört beyaz yıldızla kırmızıydı; 24 Şubat 1949'da beşinci bir yıldız eklendi. Güney Haçı, Güney Yarımküre'deki diğer ülkelerde popüler bir bayrak amblemi olmuştur. Örneğin Avustralya, Yeni Zelanda ve Brezilya tarafından kullanılmaktadır. Samoa bayrağında beyazın saflığı, mavinin özgürlüğü ve kırmızının cesaret anlamına geldiği söylenir. Ülke 1 Ocak 1962'de bağımsızlığını kazandığında ulusal bayrakta hiçbir değişiklik yapılmadı.
